Projektet Hammarby Sjöstad tillhör avdelningen Stora projekt som är en organisation inom Stockholms stads exploateringskontor.

Exploateringskontorets projektledare ansvarar tillsammans med stadsbyggnadskontoret för utformning och genomförande av stadsdelen.

Inom projektets ansvarsområde ligger ekonomi, planering, marksanering samt anläggning av stadsdelens broar, gator, ledningar och parker.