På Bernadottegymnasiet läggs extra mycket tid på fysiska aktiviteter. Utöver kursen Idrott och hälsa 1 som alla gymnasieelever ska läsa, så har eleverna en timmes fysisk aktivitet en morgon varje vecka, vilket gör att de får minst dubbelt så mycket träning under skoltiden jämfört med många andra skolor. Denna extraaktivitet kallas Onsdagsfys, och eleverna deltar i någon av följande aktiviteter.
Badminton
En tempofylld träningsform som ger koordination och kondition, vare sig det gäller singelspel eller dubbel.

Cirkelträning
Ju mer mångsidig en träningsform är desto bättre. På cirkelträningen får eleverna träna så gott som hela kroppen, såväl ben och knän som mage, rygg och armar. Intensitet blandas med lugnare tempo, allt för bästa resultat.

Fotboll
Eleverna tränar smidighet och olika konditionsövningar, både med och utan boll, allt för att bli bättre på bollspel. Dessutom spelar de naturligtvis även i lag mot varandra, oftast under den andra halvan av passet.

Löpning
Eleverna får en timmes löpning, oavsett väder och vind, vilket ökar deras kondition.

Kampsport
Eleverna får med denna aktivitet träna på flera typer av kampsport, däribland brottning, och även upplysning om hur viktigt uppvärming är för undvikande av skador.

Kalasfys
Detta är en träning inför tävlingen mellan de tre Bernadottegymnasierna i Stockholm, Göteborg och Malmö, en tävling som alltid går av stapeln på försommaren.

Simning
Att simma är en mycket nyttig träningsform eftersom det ger träning för nästan hela kroppen.

Spinning
Träning på motionscykel i omväxlande hög och låg fart, där musik hjälper till att hålla tempot.
